杏林湾水库的流域总面积约为142平方千米，首要污染源来自流域内居民的日子污水、日子废物以及工业废水排放等。为了进步杏林湾水库的水质，集美区总投资11亿元，推动各项重点工程的实施。
现在，一座座污水处理站在杏林湾流域内的社区拔地而起，污水管网也在地下悄悄延伸。对于周边的工厂，集美区请求工厂有必要建造废水处理设备或是接入市政管网，根绝直接排放。为了添加水体的流动性，集美区还为杏林湾水库的九天湖装上了“引擎”———水动力系统。
在不久的将来，杏林湾水库绿意将更浓，水面大将呈现鸟类、水生生物的栖息地。这些栖息地不只漂亮，还能进步水体的自净才能。据介绍，这些栖息地将用清淤工程的淤泥堆造而成。
据介绍，到2017年，杏林湾水库流域将基本完成截污控源工作；到2020年，水库将康复景观用水的功能；2030年，水库水质达标率将到达75%以上。