商转公顺位抵押业务流程基础步骤为，合乎公积金贷款政策的商业贷款贷款人向公积金管理明确提出商转公申请贷款；审核根据后，管理中心与借款申报人签署公积金借款（质押）合同书，在合同书中另外承诺借款申报人受权在借款派发时将借款资产划归商业贷款还贷专用存款账户；申请办理第二顺位抵押登记；顺位抵押进行后，公积金管理将公积金房贷资产划归商业贷款还贷专用存款账户，金融机构从该专用存款账户中划款资产偿还贷款人的商贷；商业贷款偿还后（公贷与商业贷款中间的差值一部分，由员工自主筹资偿还），销户商业服务购房贷款预告登记，清除第一顺位的质押。
据调查，启用商业贷款直转公贷业务流程至今，截止6月16日，已申请办理20笔，借款资产近三百万元。经计算，一样是四十万元本人购房贷款，贷款年限20年，公积金房贷与商业服务购房贷款贷款利息相差近十五万元；贷款年限30年时,贷款利息相差近25万余元。