国际学术界所说的南岛语族是指所有说南岛语的民族，语言有1100至1200种，人口超2.7亿。工作站设立后，将充分发挥考古文物资源优势，致力于加强南岛语族研究领域两岸学术教学交流，积极开展南岛语族考古发掘、学术研究、教学实习，打造两岸南岛语族涉台研究教学、学术交流和研究成果传播应用平台，积极邀请台湾学术界人士到漳平奇和洞开展考古学术交流，围绕南岛语族起源及扩散、东南沿海史前文化交流等开展学术课题合作。

漳平奇和洞遗址于2008年底第三次全国文物普查时被发现，为一处旧石器时代晚期向新石器时代早期过渡的洞穴遗址，距今约17000至7000年。2012年被评为“2011年全国十大考古新发现”，并且位居全国第二； 2013年列入第七批全国重点文物保护单位。同时，被国务院列入中华人类文明起源探源工程项目之一（福建省仅有2处入选，第一处是三明万寿岩遗址）。中科院、社科院权威考古专家做出了“北有山顶洞人，南有奇和洞人”的评价。奇和洞遗址是福建地区最早的新石器时代土著文化，它的发现填补了福建乃至中国东南区域史前文化新、旧石器过渡阶段的空白，对研究台湾史前文化源头具有重要意义。为探讨新旧石器过渡阶段人类体质演化等提供了珍贵而翔实的材料，更是对探讨南岛语族的起源与扩散、农业起源、陶器起源和早期燃煤历史等方面具有十分重要的学术价值。