内河转运区布置于吕四港环抱式港池西港池和渔港连接段，采用挖入式平面布置，一期规划建设码头泊位长度1500米，14个1000吨级泊位（其中11个装卸泊位、3个待泊泊位），年通过能力约750万吨，总投资约15亿元。

内河转运码头主体工程投入运行后，内河转运码头将与海港码头形成江海联运功能，通过通吕运河和新江海河，到达通海港区进入长江，大大提升吕四起步港区的水水中转能力，是新出海口吕四起步港区“公铁水、江海河”联运的重要一环。